
Desde la introducción sistemática de la contrarreloj desde el regreso del Tour en 1947, este reto en solitario solo ha tenido un kilometraje más breve en una ocasión: 52,3 km en 1967.
Después de la Gran Salida en Mónaco, se sucederán etapas del Tour en Francia, en España, en Andorra y en Suiza con una incursión en Italia, por ese orden, para visitar un total de 6 países. El récord, sin embargo, lo ostenta la edición de 1992, en la pasó por 7 países.
Nunca antes en la historia de esta prueba, se había programado una etapa de montaña la víspera de la llegada a París. Así será en esta edición con la llegada a la cima del Ventoux prevista para la 20ª etapa.
Desde 2005, no figuraba en el programa de la prueba la contrarreloj por equipos. Para la edición de 2009, se sumarán los tiempos reales en la línea de llegada a la clasificación general individual y a la clasificación por equipos. La clasificación de la etapa se establecerá tomando el tiempo realizado por el quinto corredor de cada equipo.
Al igual que la edición 2008, no se otorgará ninguna bonificación por los sprints intermedios ni por las llegadas de etapa. El tiempo real será la referencia absoluta.
Para la clasificación por puntos, se prevén sprints intermedios para las etapas llanas. Los primeros tres corredores de cada sprint recibirán respectivamente 6, 4 y 2 puntos.
Se ofrece un total de 3,2 millones de euros para los equipos y los corredores; 450 000 euros reservados para el vencedor de la clasificación general individual.